基因檢測(cè)對(duì)于肉瘤患者在輔助診斷方面的應(yīng)用：
NCCN指南和WHO分類中，都已明確指出不同的軟組織肉瘤亞型具有特征性的染色體易位，并且可以作為診斷依據(jù)。2019年中國臨床腫瘤學(xué)會(huì)（CSCO），第一次制定了軟組織肉瘤診療指南，也將基因異常檢測(cè)列入軟組織肉瘤診斷方法中。
基因檢測(cè)對(duì)于肉瘤患者在用藥指導(dǎo)和預(yù)后影響方面的應(yīng)用：
對(duì)軟組織肉瘤進(jìn)行基因檢測(cè)，通常對(duì)臨床有以下幫助。在軟組織肉瘤中，很多融合基因可以對(duì)預(yù)后有很好的提示作用。例如，在腺泡狀橫紋肌肉瘤中，大約60%的患者存在PAX3-FOXO1基因融合，20%的患者存在PAX7-FOXO1基因融合，存在PAX7-FOXO1的患者預(yù)后較好， PAX3-FOXO1次之，正常核型的患者預(yù)后較差；炎性肌纖維母細(xì)胞瘤（IMTs）中， 患者具有CLTC-ALK基因融合通常具有良好預(yù)后，而一旦存在RANBP2-ALK基因融合，通常意味預(yù)后不良；孤立性纖維性腫瘤中，NAB2-STAT6基因融合最常見，即使是存在相同融合基因的患者，可能由于基因融合斷裂的方式不同，預(yù)后也會(huì)不同，具有NAB2ex4-STAT6ex2/3 融合型別的患者，預(yù)后整體優(yōu)于NAB2ex6-STAT6ex16/17融合型別的患者。所以檢測(cè)融合基因，特別是確定融合基因的具體斷裂方式，對(duì)患者預(yù)后指導(dǎo)有著重要意義。
在軟組織肉瘤中，除基因融合外，基因突變發(fā)生情況較少。而胃腸道間質(zhì)瘤（GIST）是一個(gè)例外，絕大部分胃腸間質(zhì)瘤患者存在KIT、PDGFRα或BRAF突變，有研究表明，在GIST中，KIT基因Exon 9重復(fù)或exon 11缺失突變的患者預(yù)后不良，而存在exon11的突變的患者預(yù)后優(yōu)于存在exon9突變的患者.KIT存在557/558密碼子缺失突變的5年RFS更差，而存在PDGFRα突變的患者可能預(yù)后較好。另外，在17%的多形性脂肪肉瘤中發(fā)現(xiàn)TP53突變、
CDKN2A缺失突變，這兩種突變都與預(yù)后不良相關(guān)。18%的粘液樣/圓形細(xì)胞脂肪肉瘤中存在PIK3CA突變， PIK3CA團(tuán)簇的突變與上皮腫瘤中的兩個(gè)“熱點(diǎn)”相同——螺旋結(jié)構(gòu)域(E542K和E545K)和激酶結(jié)構(gòu)域(H1047L和H1047R)。螺旋結(jié)構(gòu)域突變患者的疾病特異性生存率較低?？傊浗M織肉瘤中總體基因突變發(fā)生情況雖然較少，但對(duì)預(yù)后指導(dǎo)方面具有重要的臨床意義。
在軟組織肉瘤中，針對(duì)融合基因，特別是發(fā)生率較高的特征性融合基因已經(jīng)進(jìn)行了相當(dāng)長時(shí)間的研究，對(duì)于一些疾病的致病機(jī)制和信號(hào)通路已經(jīng)有了比較深入的認(rèn)知，針對(duì)這些機(jī)制也已經(jīng)開發(fā)了很多靶向藥物，但目前被批準(zhǔn)用于軟組織肉瘤治療的靶向藥物較少，很多藥物依然在臨床研究階段。
軟組織肉瘤，發(fā)病部位可見于脂肪、筋膜、肌肉、纖維、淋巴及血管、關(guān)節(jié)內(nèi)部等。目前軟組織肉瘤已經(jīng)有超過60種亞型劃分，有些類型更容易影響兒童，而有些類型主要影響成年人。有些腫瘤亞型可能由于病理形態(tài)難以區(qū)分而被誤診。一些輔助技術(shù)可以支持形態(tài)學(xué)診斷，包括免疫組化、經(jīng)典細(xì)胞遺傳學(xué)、電子顯微鏡和分子遺傳學(xué)檢測(cè)。分子遺傳學(xué)檢測(cè)已經(jīng)成為一種特別強(qiáng)大的輔助檢測(cè)方法，因?yàn)樵S多肉瘤類型都有其特有的遺傳畸變，包括單堿基對(duì)替換、缺失和擴(kuò)增以及易位。對(duì)軟組織肉瘤進(jìn)行基因檢測(cè)，通常對(duì)臨床有以下幫助。
