BRCA檢測在不同癌種的新進展
BRCA作為一個抑癌基因,其突變的發(fā)生與腫瘤的發(fā)生和發(fā)展存在密切的關(guān)系。基于BRCA在同源重組途徑中所扮演的角色,利用協(xié)同致死的原理PARPi在卵巢癌中獲得的了巨大的成功。BRCA突變還可作為鉑類化療預(yù)后判斷的標(biāo)志物,同時也被用于指導(dǎo)卵巢癌和乳腺癌患者的遺傳咨詢,可謂應(yīng)用場景十分廣泛。其實在不同的癌種,抑或是相同癌種但不同病理類型BRCA均呈現(xiàn)不一樣的突變頻率。本文主要選取了3個不同的癌種:乳腺癌,胰腺癌和轉(zhuǎn)移性前列腺癌,進行簡單的匯總和描述。
2019年12月SABCS會議上公開了一項年輕乳腺癌患者的臨床病理特征和BRCA1/2關(guān)系的研究壁報。(ref1)1302例年輕乳腺癌患者中回顧性評估其腫瘤組織病理學(xué)特征和生物標(biāo)志物狀態(tài),主要的發(fā)現(xiàn)有:
1.在不同年齡組中(≤30、31-35和36-40歲),患者的分子表型、腫瘤分期、腫瘤分級或組織病理學(xué)特征均無顯著差異;
2.胚系BRCA1/2檢測結(jié)果中有127例(11%)呈陽性,其中65%為BRCA1,35%為BRCA2;
3.62%BRCA1突變的患者分子分型為三陰性,BRCA2患者中這一比例僅為13%,而在不區(qū)分BRCA1/2突變狀態(tài)的全部患者中,TNBC的比例為16%;然而,在 Luminal B/HER2-亞組中BRCA2突變比例比BRCA1突變更高。
對于BRCA突變在乳腺癌中的數(shù)據(jù)還是相對較多一點,但對于在胰腺癌中的突變相關(guān)報道還是比較少。
2020年ASCO-GI會議上MSKCC的研究者分享了該中心BRCA突變在胰腺癌患者中的相關(guān)研究。研究者從數(shù)據(jù)庫中找出了2011-2018年間的126例攜帶胚系或體細(xì)胞BRCA突變的胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC)患者,分析了患者的基因組圖譜、臨床病理特征和結(jié)局(ref2)。主要的研究發(fā)現(xiàn):
1.78例(62%)攜帶胚系BRCA突變;54例(43%)的一級親屬有BRCA相關(guān)腫瘤家族史;35例(28%)有其他腫瘤病史;67例(53%)有阿什肯納茲猶太人背景;13例(10%)帶有其他胚系突變;
2.隊列整體的中位OS是32.1個月,胚系突變和體細(xì)胞突變患者之間,以及BRCA1突變和BRCA2突變患者之間OS無顯著差異;
3.在研究隊列的晚期患者中,一線含鉑化療的緩解率和疾病控制率高達83%和92%;PARP抑制劑的緩解率和疾病控制率也相當(dāng)可觀,分別為34%和70%。
2020年ASCO-GU會議上分享了4000多例mCRPC患者腫瘤組織NGS的Ⅲ期PROfound研究經(jīng)驗。PROfound研究中,對4047例患者進行組織檢測,其中2792例(69%)病理檢查合格并成功進行了NGS(Foundation Medicine),分析了腫瘤樣本特征、樣本采集方法、器官組織部位以及樣本年齡對NGS檢測成功率的影響(ref3)。
本研究采用的HRR檢測panel包含15個基因(BRCA1, BRCA2, ATM, BRIP1, BARD1, CDK12, CHEK1, CHEK2, FANCL, PALB2,PPP2R2A, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD54L)。本研究主要的發(fā)現(xiàn):
1.絕大部分樣本(89.9%)來源于以往保存的活檢或手術(shù)組織標(biāo)本。兩種樣本都可以進行NGS檢測,但近期采集的新樣本檢測成功率較高。
2.轉(zhuǎn)移灶樣本檢出率要高于原發(fā)灶樣本(63.7%:56.3%)。
3.樣本采集方法也會影響檢測成功率,芯針穿刺活檢收集的多條組織應(yīng)嵌入制成一個FFPE樣本,最大限度提高病理檢查成功率。
4.不同器官類型的組織檢測成功率存在差異,其中骨骼樣本最具挑戰(zhàn)性,淋巴結(jié)檢測成功率最高。